Рубрика: Блог

Блог – статистика, биоэквивалентность, расчет объема выборки, клинические исследования, фармакокинетика.

Главные ошибки при формировании базы данных в MS Excel

Надо отметить, что главная ошибка – использование MS Excel. Я настоятельно не рекомендую использовать Microsoft Excel в качестве программы ввода данных и соответствующие файловые форматы для хранения. MS Excel часто искажает данные, возникают ошибки, неточности, неконтролируемые изменения. Валидация практически невозможна. Именно поэтому ведущие регуляции не принимают данные в этом формате. Вот тут подробно о том…

Прочитать статью целиком

Тест ClinicalTrialUtilities и ReplicateBE на Raspberry Pi 4

Ничего необчного. Дистрибутивы Linux для Raspberry Pi поддерживают установку Julia из репозитория без проблем. Достаточно выполнить: 1sudo apt install julia Дальше в среде julia установка пакетов прошла в штатном режиме: 123using Pkg Pkg.add("ClincalTrialUtilities") Pkg.add("ReplicateBE") Тест также прошел без особенностей: 12Pkg.test("ClincalTrialUtilities") Pkg.test("ReplicateBE") Все работает как и ожидалось: вы можете спокойно расчитывать выборку и считать биоэквивалетность на…

Прочитать статью целиком

Подборка полезной литературы – часть 2

An Introduction to Categorical Data Analysis Categorical Data Analysis Clinical Trials, Second Edition: Study Design, Endpoints and Biomarkers, Drug Safety, and FDA and ICH Guidelines Randomization in clinical trials : theory and practice Introduction to Statistical Methods for Clinical Trials Introduction to Randomized Controlled Clinical Trials, Second Edition (Texts in Statistical Science Series) Statistical Advances…

Прочитать статью целиком

Небольшая подборка полезной литературы

Data And Safety Monitoring Committees In Clinical Trials Epidemiology and Biostatistics An Introduction to Clinical Research Statistical Methods for Survival Trial Design: With Applications to Cancer Clinical Trials Using R Clinical trial data analysis with R and SAS Clinical Trials Design in Operative and Non Operative Invasive Procedures Analyzing Longitudinal Clinical Trial Data: A Practical…

Прочитать статью целиком

Julia – язык программирования

Julia — высокоуровневый высокопроизводительный свободный язык программирования с динамической типизацией, созданный коллективом авторов: Стефан Карпински, Джефф Безансон, Вирал Шах. 21 января 2019 был выпущен релиз 1.1.0, а предыдущая версия 1.0.3 – релиз с длительным периодом поддержки. В чем основное отличие от других средств разработки? Разумеется Julia содержит в комплекте поставки набор библиотек для выполнения операций…

Прочитать статью целиком

Степени свободы в SAS, SPSS, PhoenixWinNonlin для репликативного дизайна биоэквивалентности – сравнение

Ранее уже писал, что есть некоторое несоответствие SPSS и SAS по расчетам степеней свободы. Не могу точно сказать – какие причины приводят к различиям, но они есть. Для иллюстрации можно рассмотреть доступный датасет, который входит в состав Phoenix WinNonlin RAEBE Template – Example Data EMA 618604 2008 Rev 7.xls Выполним код SAS для этого датасета:

IBM SPSS + R Project: Доверительные интервалы для пропорций, независимые группы

Сравнение пропорций является одним из основных методов описания данных и проверки статистических гипотез. И наиболее ценным является интервальная оценка методом построения доверительных интервалов. Гипотезы эффективности, не меньшей эффективности, эквивалентности могут быть проверены с помощью построения доверительных интервалов. Но если мы посмотрим на набор инструментов IBM SPSS, то нам может сперва стать немного дурно, так как…

Прочитать статью целиком

R Project: инструменты для рандомизации в клинических исследованиях

Речь пойдет о двух библиотеках для создания рандомизационных последовательностей. В чем суть проблемы? – Может показаться, что для составления рандомизационных последовательностей подойдет любой способ случайного распределение в группы. Однако, прежде всего необходимо ответить на вопрос: каковы критерии “правильной” рандомизационной последовательности? Попробуем их сформулировать: Рандомизационная последовательность не должна быть привычной, т.е. одной и той же или…

Прочитать статью целиком

Mediana: an R package for clinical trial simulations – пакет для симуляции клинических исследований

Mediana is an R package which provides a general framework for clinical trial simulations based on the Clinical Scenario Evaluation approach. The package supports a broad class of data models (including clinical trials with continuous, binary, survival-type and count-type endpoints as well as multivariate outcomes that are based on combinations of different endpoints), analysis strategies…

Прочитать статью целиком